北京航空航天大学环境生物学与生命保障技术研究所以深空、深海等特殊环境生命保障理论和技术为主要研究方向，同时立足民生，开展健康保障、环境生物技术与理论研究。研究所下设特殊环境生命保障组，环境生物技术组、健康保障组。
特殊环境生命保障组：面向载人登月、火星探测、月球/火星基地、深海空间站等载人深空、深海探测需求，岛礁、高原等特殊环境下工作的人员蔬菜保障需求，系统开展生物再生生命保障系统(BLSS)理论和关键技术研究。其中包括密闭舱室中植物与食用真菌高效培养技术、动物饲养技术研究，系统稳定运行与调控理论和技术研究，密闭舱室中微生物防治理论与技术研究，特殊环境生物安全理论与技术研究等。
环境生物技术组：面向可再生能源发展需要和我国环境问题，系统开展微生物燃料电池（MFC）理论和技术研究，生物活性炭水处理技术研究，水质综合毒性实时监测和快速预警理论和技术研究，生物转化固体废物制备植物栽培基质技术研究等。
健康保障组：面向目前国家优先发展的全民健康战略需求，开展饮食与肠道健康研究，情绪与肠道微生物研究，健康光源研究，精神卫生生物疗法研究，开展基于大数据和精准医疗理念的精神疾病预警、诊断策略和治疗模式研究等。
在“月宫一号”中进行植物传粉 “月宫一号”中家蚕饲养的研究
“月宫一号”中黄粉虫饲养的研究 污水处理与净化相关实验装置
微生物燃料电池技术的研究 水质综合毒性生物电化学预警仪
